八公山丰富的自然资源可用“林密、石奇、泉古、水秀”八个字来概括。这里有面积达10余平方公里的天然次生林，植被保护良好，乔木高大，树种繁多，山林茂密。由于流水剥蚀、溶蚀、风化作用，裸露的石灰岩体流纹深刻，造型生动，似微缩“锦绣河山”，呈“石林”状排列，绵延数平方公里，十分壮美。
历史上的八公山，林木离离，芳草萋萋，珍禽啾啾，异兽啸啸。淮夷人在此渔猎稼穑，蔡楚君王在此张弓弋猎。淮南王刘安修筑行馆，在密林幽泉之间寻章索句，与江淮才俊纵论治国之策。遍布于八公山间的汨汨清泉，滋育着原始植被，淮南王以此修炼丹药，创制豆腐琼浆。八公山所产青樌、红樌，向来有名。据李兆洛嘉庆《凤台县志》所载：“青樌，色青黑，坚致类海楠；红樌，红泽，皆他处所无。”由于八公山方圆不过百余平方公里，自然生态相对脆弱，到了晋代，原始植被在历次的争战中已经破坏殆尽。《晋书》记载道：“八公山草木皆如人形”。前秦王苻坚在与东晋兵交战前，看到晋军旌旗严整，连八公山上草木也当作晋军，在风声鹤唳中，苻坚望而生畏。
历经兵燹之后，八公山次生植被经历了一次又一次的复苏。到了清代，八公山次生植被中，经济林木已占有相当比重，桃，李、柿、枣、杏、石榴等遍布。清中期，寿州孙氏在八公山中建青琅玕馆，为私家园林。青琅玕馆不断扩大规模，由白鹗山下迤逦而南，林密泉幽，枫丹露白，精致的馆舍点缀其中，分别由上、中、下三部分，俗称孙家花园。由于青琅玕馆的存在，有效地保护了山林植被。此后，八公山又经历数次战火的洗礼，其他山头受到比较严重破坏，但孙家花园一带依然保留了较为完好的次生植被。
随着经济的发展，人与自然和谐共处成为一个日益突出的课题，八公山生态建设成为共同关注的话题。在打造山水园林城市的总体思路指导下，八公山森林公园的建设被列上日程。南塘盆地，孙家花园一带，向来植被状况良好，是八公山森林公园建设的重要依托。1987年，省人民政府确定八公山为省级风景名胜区，围绕南塘湖景区的绿化与美化，淮南市率先开始了森林公园的建设步伐。经过多年努力，南塘盆地郁郁葱葱，自然生态得到极大改观，在建设八公山国家AAAA级风景名胜区的规划中，森林公园的范围进一步扩大。特别是孙家花园一带，由于保护较好，以麻栎、栓皮栎等高大乔木为主的次生植被浓荫覆盖，生物多样化程度较高，经过进一步保护和建设，八公山国家级森林公园获准建立。各项保护措施进一步到位，为八公山的生态建设提供了重要保证。
与此同时，卧龙山景区建设了卧龙山森林公园，公园围绕卧龙湖展布，大大改善了八公山南麓的生态条件。凤台县利用茅仙洞景区为依托，建成茅仙洞景区森林公园，由三峰山到硖石古寺，沿淮右岸自然生态得到优化。寿县则依托古城大做绿色文章，四顶山景区于1992年建成省级森林公园，森林公园拱卫着古城，古城作为重要载体，为森林公园的建设提供了坚实基础。
每当阳春三月，八公山上，草长莺飞，梨花似雪，桃花如霞，蔚为大观。金秋时节，硕果累累，百里飘香。四周连片的黄连木林，叶红似火，可与“香山红叶，岳麓红枫”媲美。以侧柏为主的针叶林，一年四季常青常绿。历史上，八公山是一座生态名山，这一生态名山的风采正在得到恢复，并以崭新的面貌重新出现在世人面前。