黑龙江现有哈尔滨、齐齐哈尔、牡丹江、佳木斯四个民用机场，其中哈尔滨太平国际机场是全国八大民航机场之一，已成为我国东北第二大国际航空港。
哈尔滨国际机场有定期航班飞往北京、天津、上海、南京、青岛、温州、厦门、广州、深圳、沈阳、大连、西安等三十多个大、中旅游城市。此外，还有飞往俄罗斯远东的布拉格维斯申科、哈巴罗夫斯克、符拉迪沃斯托克、韩国的汉城和日本新泻的航班。
铁路
黑龙江是我国修建铁路最早的省份之一，交通运输以铁路为主干，沙俄势力侵入我国东北后，于1897年开始修筑黑龙江省的第一条铁路——北满铁路（今称滨绥和滨洲铁路）。
全省铁路26条，干支线以哈尔滨、齐齐哈尔、牡丹江、佳木斯4个经济中心城市为轴心向四周辐射，并通过国际干线和国内干线外接俄罗斯、朝鲜，内联吉林、辽宁和内蒙古。
其中，滨绥和滨洲铁路与俄罗斯西伯利亚大铁路相接，牡（丹江）图（们）铁路与朝鲜相通。京哈、拉滨、平齐、通让、牡图5条铁路干线与全国铁路相接。全省铁路营运里程5121公里，居全国之冠。
公路
黑龙江省现有国道7条，公路通车里程46617公里，居全国第五位。高速公路已建成“大庆——哈尔滨——牡丹江——绥芬河”、“102国道省界——哈尔滨——佳木斯——鹤岗”2条，大庆——齐齐哈尔，佳木斯——同江，102国道省界——长春的高速公路正在建设中。届时，从齐齐哈尔或同江经哈尔滨走高速公路可直达首都北京。
水运
黑龙江省水利资源丰富，居东北三省之冠，全省内河通航里程达4696公里，现有直营客运航线9条，以松花江、黑龙江、乌苏里江为骨干，以哈尔滨和佳木斯港为枢纽的水运网贯穿全境。
其中，松花江航线是黑龙江省水运干线，每年5-11月通航；黑龙江航线位于中国最北部，在同江和俄罗斯哈巴罗夫斯克（伯力）与松花江和乌苏里江相接；乌苏里江航线为中俄界河航线，冬季封冻。